ट्रांसक्रिप्टोमिक्स ट्रांसक्रिप्टोम का अध्ययन है जो एमआरएनए, आरआरएनए, टीआरएनए और जीनोम द्वारा उत्पादित अन्य गैर-कोडिंग आरएनए ट्रांसक्रिप्ट सहित अणुओं सहित सभी आरएनए का पूरा सेट है। ट्रांस्क्रिप्टोम्स का उपयोग तुलनात्मक उद्देश्य के लिए किया जा सकता है जो उन जीनों की पहचान करने की अनुमति देता है जो अलग-अलग सेल आबादी में अलग-अलग तरीके से व्यक्त होते हैं।