16एस राइबोसोमल आरएनए प्रोकैरियोट्स में 30एस राइबोसोम की एक छोटी उप-इकाई है। 16एस राइबोसोमल आरएनए के लिए जीन कोडिंग 16 एस आरआरएनए है। इसका उपयोग फ़ाइलोजेनीज़ के पुनर्निर्माण के लिए किया जाता है। एक ही जीवाणु में, 16S rRNA के कई अनुक्रम मौजूद हो सकते हैं। 16एस राइबोसोमल आरएनए (आरआरएनए) अनुक्रमण एक सामान्य एम्प्लिकॉन अनुक्रमण विधि है जिसका उपयोग किसी दिए गए नमूने के भीतर मौजूद बैक्टीरिया की पहचान और तुलना करने के लिए किया जाता है। 16एस आरआरएनए जीन अनुक्रमण जटिल माइक्रोबायोम या वातावरण से नमूनों की फाइलोजेनी और वर्गीकरण का अध्ययन करने के लिए एक अच्छी तरह से स्थापित विधि है जिसका अध्ययन करना मुश्किल या असंभव है।
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