डेनोवो अनुक्रमण को पेप्टाइड अनुक्रमण के रूप में परिभाषित किया गया है। पेप्टाइड अनुक्रमण को जीव में मौजूद पेप्टाइड बांडों के अनुक्रमण के रूप में परिभाषित किया गया है। इसे शॉर्टगन लाइब्रेरीज़ और लंबी जोड़ी-अंत लाइब्रेरीज़ का उपयोग करके किया जाता है। किसी विशेष जीव के प्राथमिक आनुवंशिक अनुक्रम की प्रारंभिक पीढ़ी को डेनोवो अनुक्रमण कहा जाता है। किसी भी जीव का विस्तृत आनुवंशिक विश्लेषण डेनोवो अनुक्रमण के बाद ही संभव है। डे नोवो अनुक्रमण आम तौर पर संदर्भ अनुक्रम की अनुपस्थिति में अलग-अलग अनुक्रमों को लंबे सन्निहित अनुक्रमों या सही ढंग से क्रमबद्ध कॉनटिग्स को इकट्ठा करके पूरा किया जाता है।
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